Лаборатория экологического мониторинга предназначена для контроля загрязнения окружающей среды и ущерба экологии в определённой заданной точке местности путем оценки санитарно-гигиенического загрязнения атмосферного воздуха, воды, почвы, донных отложений и др. с использованием методов газо-жидкостной и ВЭЖ хроматографии, а так же атомно-абсорбционной, рентгенфлуоресцентной, радиационной, электрофоретической и флуоресцентной спектрометрии. Приборный парк лаборатории и перечень аттестованных аналитико-измерительных методик позволяет осуществлять разработку нормативов предельно допустимых выбросов, с целью обеспечения государственного или ведомственного контроля.
Приборная база лаборатории:
1. Газоаналитический комплекс для экологического монитринга воздуха (Environnement S, Франция), предназначенный для решения задач непрерывного мониторинга качества атмосферного воздуха с использованием фуориметрического и хемилюминесцентного детектирования, а так же газовой хроматографии. Газоаналитический комплекс сформирован на основе следующих приборов:
- газоанализатор оксида серы SO2/H2S, основанный на флуориметрическом детектировании с диапазоном измерения для SO2: 0 – 10.0 ppm и для H2S: 0 – 1.0 ppm;
- газоанализатор оксидов азота NO – NO2 – Nox/N H3, основанный на методе хемилюминесцентном детектировании с диапазон измерения для NO – NO2 – Nox: 0 – 20 ppm и для N H3: 0 – 2 ppm;
- газоанализатор оксида углерода CO с диапазон измерения: 0 – 200 ppm;
- газоанализатор для измерения общего содержания углеводородов, метана, основанный на методе газовой хроматографии с диапазон измерения: 0 – 1000 ppm;
- автоматический анализатор пыли PM10/PM2.5/PM1, основанный на методе радиационной спектрометрии с использованием слабоактивного источника С14с диапазоном измерения: 100 – 10000 мкГ/м3;
- телескопический пробоотборный зонд с подогревом;
- автоматическая метеостанция, включающая метеомачту, датчики температуры и влажности, давления, направления и скорости ветра.
2. Атомно-абсорбционный спектрометр МГА-915 (ГК «ЛЮМЭКС», РФ) представляет собой спектрометр с электротермической атомизацией и Зеемановской коррекцией неселективного поглощения, предназначенный для измерения содержания элементов (Ag, Al, As, Au, Ba, Be, Bi, Cd, Co, Cr, Cu, Fe, Hg, Mn, Mo, Ni, Pb, Pd, Pt, Rh, Ru, Se, Sn, Sb, Sr, Ti, V, Zn и др.) в широком круге объектов: различных типах вод (питьевые, природные, сточные, морские), атмосферном воздухе, почвах, донных отложениях и осадках сточных вод, пищевых продуктах и сырье, биологических тканях и жидкостях, продуктах нефтехимического производства, а также металлах и сплавах и иных объектах. 
3. Рентген-флуоресцентный спектрометр Спектроскан Макс-G (ГК «ЛЮМЭКС», РФ). Волнодисперсионный рентгенфлуоресцентный спектрометр предназначен для быстрого неразрушающего определения качественного и количественного элементного состава от Na до 92U в твёрдых и жидких образцах, порошках, гранулах, пластинах, плёнках, а также для определения состава и толщины покрытий. В комплекс е со специальным программным обеспечением данный прибор в металлургии, машиностроении, сельском хозяйстве и пищевой промышленности, геологии, экологии, химии и т.п.
4. Рентгенофлуоресцентный анализатор Delta Premium Explorer (Olympus Corporation, Япония) предназначенный для экологического мониторинга почв, воды и донных отложений на содержание в них тяжелых, токсичных и загрязняющих, радиоактивных металлов; оценки загрязнения территорий после экологических катастроф с возможностью картирования в диапазоне элементов от Mg до Pu с чувствительностью на уровне 1 ppm в режиме реального времени.
5. Система капиллярного электрофореза Капель-105М (ГК «ЛЮМЭКС», РФ). Прибор предназначен для выполнения измерений массовых концентраций таких анионов как хлорид-ионов, нитрит-ионов, сульфат-ионов, нитрат-ионов, фторид-ионов, фосфат-ионов, а также катионов калия, натрия, лития, магния, кальция, аммония, стронция и бария в пробах природных, питьевых и очищенных сточных пробах природных, питьевых и очищенных сточных вод.
6. Многопараметрический прибор для определения качества воды U-53 (Horiba Jobin Yvon, Япония), позволяющий контролировать до 11 параметров воды в реальном времени, включая высокоточное измерение мутности.
7. Анализатор жидкости «Флюорат-02-3М» (ГК «ЛЮМЭКС», РФ), предназначен для измерений массовой концентрации неорганических и органических соединений в воде, а также воздухе, почвах, технических материалах, пищевых продуктах и других объектах после переведения анализируемых веществ в раствор.
8. СВЧ-минерализатор «МИНОТАВР-2» (ГК «ЛЮМЭКС», РФ), предназначенный осуществления пробоподготовки путем разрушения органических веществ в природных, питьевых и сточных водах, биологических объектах и пищевых продуктах при проведении физико-химического анализа на загрязняющие примеси тяжелых металлов любыми методами и может применяться для гидролиза, экстракции с использованием полярных и неполярных органических растворителей, СВЧ-сушки и синтеза.
9. Дозиметр-радиометр МКС-АТ1117М (ГК «ЛЮМЭКС», РФ) предназначен для измерения мощности амбиентного эквивалента дозы и амбиентного эквивалента дозы рентгеновского, гамма- и нейтронного излучения, плотности потока альфа- и бета-частиц с загрязненных поверхностей, поверхностной активности, а также плотности потока нейтронов.
10. Термореактор «ТЕРМИОН» (ГК «ЛЮМЭКС», РФ) предназначен для нагревания проб в реакционных сосудах до заданной температуры и выдержке при ней заданное время и применяется в качестве вспомогательного оборудования в аналитических лабораториях для определения ХПК.
Материально-техническая база:
Лаборатория экологического мониторинга включает два лабораторных помещения общей площадью 42 кв. м. инженерное состояние, которых соответствует требованиям, предъявляемым к эксплуатации высокоточного научного оборудования. В частности, лабораторные помещения имеют высокостабилизированное электропитание, раздельное двухконтурное заземление, водопровод, канализация, тепло, кондиционирование, вентиляция, водяное охлаждение, интернет, телефон. Кроме того в Лабораторию экологического мониторинга входит Передвижная лаборатория экологического контроля, сформированная на базе на шасси КамАЗ-43118 повышенной проходимости, предназначена для проведения различных работ, измерений и анализов с использованием описанного выше комплектом оборудования в удаленных районах в радиусе 500 км без дозаправки и в районах с холодным климатом (до -30 оС).
Методики исследования:
- комплекс методик определения концентрации анионных поверхностно- активных веществ, сульфидов, мышьяка, нефтепродуктов, фенолов (общих и летучих), бихроматной окисляемости (химического потребления кислорода), цианидов, нитрит-ионов, токсичности вод, водных вытяжек из почв, осадков сточных вод и отходов по изменению уровня флуоресценции хлорофилла и численности клеток водорослей на анализаторе жидкости «Флюорат-02»;
- комплекс методик выполнения измерений массовых концентраций и массовой доли ртути, ванадия, кадмия, кобальта, марганца, меди, мышьяка, никеля, ртути, свинца, хрома и цинка алюминия, бария, бериллия, ванадия, железа, кадмия. кобальта, лития, марганца, меди, молибдена, мышьяка, никеля, олова, свинца, селена, стронция, титана, хрома, цинка в атмосферном воздухе, природных и сточных водах методом атомно-абсорбционной спектроскопии с пользованием атомно-абсорбционного спектрометра с электротермической атомизацией «МГА-915»;
- комплекс методик выполнения измерений массовых концентраций уксусной кислоты, хлорид-ионов, нитрит-ионов, сульфат-ионов, нитрат-ионов, фторид-ионов и фосфат-ионов в пробах почв, грунтах тепличных, глинах, торфе, осадках сточных вод, активном иле, донных отложениях природных, питьевых и очищенных сточных вод с применением системы капиллярного электрофореза «Капель»;
- комплекс методик измерений массовой доли кадмия, свинца, мышьяка, ртути, железа, меди и алюминия методом атом-но-абсорбционной спектроскопии в алкогольных и безалкогольных напитках с использованием атомно-абсорбционного спектрометра с электротермической атомизацией модификаций «МГА-915»;
- комплекс методик выполнения измерений массовых концентраций ванадия, висмута, железа, кобальта, марганца, меди, никеля, свинца, хрома, цинка в порошковых пробах почв, в питьевых природных и сточных водах с использованием ренгенофлуоресцентного спектрометра «Спектроскан Макс-G»;
- комплекс методик рентген-флуоресцентного качественного/ количественного анализа на содержание тяжелых, токсичных и радиоактивных элементов от Mg до Pu в пробах почв, воды и донных отложений с возможностью картирования.